中国是日本第一大贸易伙伴、第一大出口目的地和最大的进口来源地。中国海关数据显示，2010年中国对日本贸易逆差为556.5亿美元，扩大68.5%。而根据日本的统计，2010年中日两国间的贸易总额为3018.5亿美元，与2009年相比，增长率为30%。同某一贸易国的贸易总额超过3000亿美元，在日本历史上尚属首次。
此次地震后，中日之间的贸易短期内会受到一定程度的影响。商务部亚洲司相关负责人表示，一部分制造企业如果在地震中受损，生产恢复可能需要一段时间，那么整体进货、销售都会受到影响，会对日本对外供货产生不利影响。中国机电进出口商会成套设备部负责人韩圣健则表示，对于电子高端产业来说，由于中国承接了一些从日本转移的加工贸易，对于那些从日本进口零件组装再销售海外的企业来说，可能会间接受到影响。而香港与日本贸易的情况也从侧面反映了这种短期冲击。
据报道，经成田机场运到香港的鲜鱼海产即使停售，日本进口食材亦有涨价压力;而日本车企停产，也会推高进口车价。而在出口方面，空运东京的货物需转飞其他城市，导致运费上升，跨国快递公司也中止了受影响地区的服务，将延误邮件的送达。Fedex表示，在日本东部的收件和派件服务暂停，但在海外仍会接收送往当地的邮件，但运送会有迟延。